A CZDP conta com amplo acervo didático, aberto à visitação, além de um acervo científico, de acesso restrito, dividido em quatro coleções:
Coleção de Crustáceos http://splink.cria.org.br/manager/detail?setlang=pt&resource =CZDP-Crustacea
Coleção de Peixes http://splink.cria.org.br/manager/detail?setlang=pt&resource =CZDP-Pisces
Coleção de Anfíbios http://splink.cria.org.br/manager/detail?setlang=pt&resource =CZDP-Amphibia
Coleção de Répteis http://splink.cria.org.br/manager/detail?setlang=pt&resource =CZDP-Reptilia
Ambos os acervos estão em constante expansão, visando ampliar a produção e a divulgação de conhecimento sobre a fauna do Delta do Parnaíba.