As incubadoras podem ser de três tipos, dependendo do tipo de empreendimento que abriga.
Incubadora de Empresas de Base Tecnológica
É a incubadora que abriga empresas cujos produtos, processos ou serviços são gerados a partir de resultados de pesquisas aplicadas, nos quais a tecnologia representa alto valor agregado.
Incubadora de Empresas dos Setores Tradicionais
É a incubadora que abriga empresas ligadas aos setores tradicionais da economia, as quais detém tecnologia largamente difundida e queiram agregar valor aos seus produtos, processos ou serviços por meio de um incremento em seu nível tecnológico. Devem estar comprometidas com a absorção ou o desenvolvimento de novas tecnologias.
Incubadoras de Empresas Mistas
É a incubadora que abriga empresas dos dois tipos acima descritos.